Многочисленные сорта лимона в культуре делят на две группы — древовидные (высокорослые — до 6 м высотой — деревья; плоды образуются в глубине кроны) и кустовидные (небольшие (до 3—4 м высотой) кусты с менее густой кроной; плоды образуются на концах ветвей). Кустовидные сорта менее урожайны, чем древовидные.
За рубежом широко используют сорта 'Лисбон' (из группы древовидных), 'Вилла Франка' и лимон Мейера (кустовидные). В СССР выращивали сорта местной селекции — 'Новогрузинский', 'Новоафонский', 'Ударник'. В траншейной культуре наиболее широко применялся лимон Мейера, представляющий собой гибрид апельсина и лимона.